409年——414年 刘裕北伐灭南燕，收复山东。卢循进攻建康兵败亡身，晋军广州。晋军西征收复益州。
在东晋内乱期间，与东晋接壤的北方胡国趁机蚕食东晋的领土。
后秦连下东晋南乡（河南南阳浙川县南）、顺阳（河南南阳浙川县东南）、新野（河南南阳新野县）、舞阴（河南驻马店泌阳县西北）等十二郡。
刘裕灭掉桓玄后派人去后秦讲和，要求后秦归还十二郡。
后秦在西线面临南凉北凉的压力，在东线面临北魏的压力，不愿再招惹东晋。刘裕以寡击众打败了桓玄显示出极强的战斗力。后秦皇帝姚兴对刘裕多有敬畏。姚兴同意与东晋化敌为友，归还了新占领的十二郡。
刘裕随后派兵西征，去收复被谯纵占领的巴蜀。
不幸的是，西征军刚攻入巴蜀便发生兵变。西征军的参军杨承祖杀了主将司马荣期，占据巴郡，自封巴郡刺史。第一次西征无疾而终。
刘裕只得组织部队再次西征。西征军杀入巴郡杀死杨承祖。西征军收复巴郡后继续西征，打到距成都还有五百里的地方遇到谯纵军队的顽强抵抗。谯纵军凭借险要的地势阻击晋军。晋军大战六十天不能攻克。军中流行瘟疫，病死的人