再加上红叶军多来自近畿和尾浓等地，在纪伊地区水土不服，更是加重了这病情。疫病很快蔓延开来，可是红叶军从未遇到这样的情形，以至于医生的数量和药品的储备都远远不足，无法有效控制疫病传播。
雨秋平匆忙临时派人回到河内和泉，让留守的直江忠平收集药品、募集医生派往前线，可是估计已经来不及了。就算来得及，红叶军那被大雨和山路困扰的补给线也没办法把他们和粮食一起送往前线。红叶军面临着要么病死，要么饿死的窘迫情况。
8月19日，雨秋平又一次视察部队，病号的数量明显比上一次又多了不少。虽然这病没有多严重，但是感冒发烧的士兵显然需要休息，而无法继续干活了——这又恶性循环，进一步加重了后勤压力。前线后勤压力最吃紧的地方养着1000多病号，他们不能干活反倒需要吃饭。然而，眼前道路那可怜的通行量根本不可能后送伤员。
雨秋平无奈之下，在征求了竹中重治、天野景德、真田昌幸等人的意见后，决定撤军。他向后方的直江忠平下令，让他开始疏通后方的道路，停止运送辎重。同时派人告知御前崎仲秀和池田恒兴，让他们也准备撤退。雨秋平安排人手砍伐木材制作了大量的担架，来抬着那些无法行动的伤病员返