方以智听了朱由检的话后，一时不知道该怎么说才好。
但他还是不甘心，不甘心大量士子流放偏远之地。
于是，方以智只得强行解释道：“陛下容禀！士族固有自私之处，以致当时拒绝陛下南迁，险使陛下处于险境！然当时的确是没有料到李自成会迅速攻陷江南，也的确只是担心陛下来南京，会滋扰江南士民！”
“非江南士民不忠于陛下，如今陛下因此记恨于江南士民，是江南士民应有之罪，如今陛下也显示了雷霆手段，臣等江南士族也知道了何为帝王之怒！”
“故请陛下放过我等士族，以宽仁治国，饶恕我江南子民之违逆之罪！”
“臣保证，以后江南士族必不再为难陛下，陛下要禁止私人结社，我们可以不结社，陛下要追缴欠税，我们可以补缴税银，陛下要去南京，哪怕是去苏州，杭州，我们也不再阻拦，并恭迎陛下巡幸江南各地，只求陛下能再施恩于我江南士民！”
方以智说完就再次跪拜在朱由检面前。
为了能让被流放的大量士族子弟回来，为了能让皇帝陛下与江南士族握手言和，他甘愿放低姿态。
但朱由检只是淡淡一笑：“早知今日何必当初。”