总之，拓跋焘认为佛教是北魏江山稳定的隐患，决定铲除祸根。
崔浩建议“悉诛天下沙门，毁诸经像”。
拓跋焘批准，下诏禁止信仰“胡神”（外来宗教，即佛教）及建造胡神的泥像铜像，违令者斩；胡教的经书、神像一律销毁；“沙门无少长悉坑之”。谁敢藏匿僧人，满门抄斩。
拓跋焘“先尽诛长安沙门，焚毁经像”。太子拓跋晃留守京城。他接到灭佛诏书后没有立即执行而是上书反对。因为他信佛。但他上书三次都被驳回，不敢抗旨不尊，只得传达灭佛令。但这么一耽误，很多僧人得到消息都跑进深山避难，或隐姓埋名藏入民间。
拓跋焘史称北魏太武帝。因此拓跋焘灭佛又被称为“太武灭佛”。
这是史上第一次灭佛行动，也是最惨烈的一次。“一境之内，无复沙门”。
佛家痛恨拓跋焘，更痛恨崔浩，认为灭佛完全是崔浩挑唆所至。崔浩后来被拓跋焘处死，佛家幸灾乐祸，称之为报应。其实崔浩被杀跟灭佛没一点关系。他是因为晚年修国史，据实记载北魏的黑历史，被鲜卑贵族告到拓跋焘那里。拓跋焘认为他有意丑化北魏的列祖列宗，下令将其处死。
南朝的刘宋没有灭佛，但对佛