原本早在三纵一成立，首任司令员也就是原来的三分区司令员，就点名要李子元。..co新任军区司令员说通了政委，点名李子元留下也最终无可奈何。政委说话了谁也不敢去改变，李子元也只能留下。
如果说原来一二九师的部队是一个大家庭的话，说有些婆婆嘴的师长是一位慈母，那一向驭下极严格的政委就是一位严父。在干部调动这件事情上，师长一向都是给政委予以充分尊重的。要不然，后来的晋冀鲁豫野战军怎么会被称为刘邓大军？
由太行军区组建的第一个纵队时候，李子元被新任军区司令员给硬扣了下来。结果在新组建六纵的时候，原本已经定了担任旅长的李子元，还是因为这个原因被留下，担任太行军区独立旅的旅长。
到了四七年太行军区组建九纵队的时候，同样已经内定为旅长的李子元，因为新部队与四纵队组成一个兵团，主要负责外线与机动作战。除了晋南之外，基本上已经不在山西战场作战。
在接替指挥山西战场的晋冀鲁豫军区第一副司令员，原来的红四方面军总指挥，又用同样的理由点名将给硬留了下来。李子元就以地方武装的身份，先后参加了太行军区参加的历次作战。
从晋南到豫北，在从陇