进入龙脉的核心结界以后，水木当着众人的面恢复原身，然后跳进龙脉能量柱里，获得了更加强大的力量。
波风水门连同众人连忙关闭龙脉，穿越到砂隐40年的人全都回到了各自的时代。
水木回到木叶60年，和大蛇丸接触，参与到木叶毁灭计划，和大蛇丸联手杀死了三代目火影猿飞日斩。
大蛇丸也因此没有被尸鬼封尽伤到。
混乱之中，入侵木叶的人纷纷离开了。
水木的爱人椿无法接受这个事实，离开了木叶，去追捕水木。
而水木的学生奈良余人则找到了迈特凯，经过一番乞求，成为了迈特凯的弟子，开始学习禁术八门遁甲。
在所有人都把目光注视到水木身上的时候，大蛇丸照常把宇智波佐助捉来培训成一个强大的容器，剧情照常发展。
而水木为了弥补精神力量方面的弱点，用草雉剑，从大蛇丸手上，交易到了灵化之术，通过不断钻研，终于研究出强化灵魂的手段。
他躲在音隐村修炼，结果还是被椿找到了。
但是那个时候，水木正在修炼灵魂，进入了沉睡的状态，对椿的到来毫不知情。
椿进入音隐村以后，和药