瞿公正色道：“你原本身为明将，既不能尽忠本朝，又不能自起逐鹿，为虎作伥，却还自夸荣耀，本阁都为你感到羞耻。本阁累爱国恩，位至三公，值此国难当头，自当为国殚精竭虑，驱除异族，扫清中原，今既大志不遂，落于你等之手，本阁自感有负国恩，虽死已晚，岂可厚颜乞命？你若真有体恤之心，就请给我们一个痛快，也算是成我们了。”
孔有德闻言，知道二人一时不会屈服，便将之移诸别室软禁赶来，每日好酒好饭相供，还请医者为张同敞治伤，同时轮番派遣说客向二人劝降，二人却然不理，只以诗词唱和作为消遣。就这样过了月余，瞿公见求死不能，惟恐讹言流传，毁了自己声誉，便写了几道连络诸将的檄文置于案头，故意让清兵搜去献给孔有德。孔有德怕夜长梦多，只得下令将二人处斩。
行刑那天，孔有德命人将二人牵至独秀峰前，瞿公道：“本人生平最爱山水，能得以死在这里，余愿足矣！”言罢正了正衣冠，南面朝拜已罢，和张同敞一道引颈就戮。不料二人受刑时却怪事迭起，本来张同敞刑前一直在高呼“大明”，第三声刚叫得一声“大”，刽子手刀已落下，头颅落地，尚还清晰地叫出了那一声“明”，尸身却直立不仆。而那头颅“明”声刚落，却又猛地跃起