为首的黄河流域部落，与以蚩尤为首的长江流域的部落发生战争，由于蚩尤一方使用各种神奇的动物来帮忙，打得黄帝节败退。
黄帝处于弱势之后，就请天界的诸神帮忙，应龙也应邀下界，在战争中立下汗马功劳，杀了蚩尤和夸父。
虽然杀了蚩尤与夸父，但由于战争消耗能量过大，应龙也受了重伤，再也无力振翅飞回天界。
蚩尤死后，双眼始终不闭，轩辕黄帝担心他会复活，于是听从了手下建议，斩下了蚩尤的首级和四肢，并将他的四肢封印于“四极”之地，并派大将看守，至于这头颅却是应龙“自告奋勇”要求看守的，因为人毕竟是他所杀。
应龙用仅剩的神力，将蚩尤封印在了这地下石门后的“山海界”内，这也是当初蚩尤召唤那些“异兽”的出处，并布下了阵法。
做完这些后，应龙也将近“油尽灯枯”，黄帝不忍他就此陨落，于是留下一物助他看守此处，然后就此离去。
但他终究是油尽灯枯，黄帝所留之物虽然对他有用，但也只是保住他的灵魂而已，身体逐渐被当时所受之伤侵蚀、腐朽，最后灵魂得以保下来。
再说蚩尤，当时他虽死，但其实并未死透，他头颅的“识海”中保留着他的一丝