而武士本身地位是依赖世袭和战功，根本不需要依靠儒学的科举。
德川家康建立幕府后，认识到中国的朱子理学对其统治十分有力，这才大力宣传朱子理学，在各藩普遍建立藩校，以朱子理学为重要内容。
如林罗山等现幕府儒学官就是那个时期得到了德川家康的支持，从而能够在幕府任职的。
然而，即便德川家康大力扶持了朱子理学，给予日本儒界资助，但和从前幕府相比也是换汤不换药。
毕竟，武士学朱子学，除了识字外只是学一个大义名分，学效忠家主道理。更深层的内容，藩校不可能教授，也不会让武士去琢磨。
至于什么“民贵君轻”的圣贤道理，幕府更是不可能允许武士们去学。
这导致儒学成了日本官方的一种工具，而不是信仰。
也演变成日本的武士在学习了儒家思想后，和儒者也依旧不沾边。而那些自愿追随老师学习儒家思想的日本平民子弟，则因为没有科举制度不能当官，只能永远在中底层打层，能够成为大名的家臣替其书写，已是这些平民子弟最大的幸运了。
久而久之，现今日本的儒学传播就具有极大的局限性，不能给平民子弟带来利益的儒学，自然就不会成