星历3007年，人类和兽人一起启动了名为“实验者”的改造计划。
参与计划的是从各个星球选取的纯种人类，计划经过为期十年的休眠调整，大幅提升实验者的精神力与体能，使之具备驾驭人形机甲作战的能力。
但谁也没有想到，计划启动之后不足三年，人类和兽人之间的邦交就彻底崩盘了。
起因是星历3009年，载有双方科学家的科研飞艇在银河系外发现了新能源，就在人们热切盼望着飞船早日带着新能源凯旋时，飞船却离奇的失踪了。
“兽人试图霸占新能源！同胞们或已罹难！”
言论不胫而走，两族的冲突从此层出不穷，以至于在地球生活了几代的兽人不得不陆续迁徙离开。到年底，随着天才兽人科学家冈瑟的失踪，导|火|索终于彻底点燃——战争打响了。
面对天生具备S级体能，可以驾驭新型战斗机甲的兽人，被逼入绝境的人类把所有的希望都寄托在了当年的那300个实验者，和仅存的高性能人形机甲【魂机】上。
但是因为战争的关系，实验基地早已损毁，实验者们死的死、失联的失联，能被E.R.A重新找到的寥寥无几，而这些被找到的人因为休眠时间不足计划