有胜负，局势一度进入相持阶段。
天启三年（1623年）春，朱燮元吸取了“我以分，贼以合”因而未能彻底平叛的教训，决定集中兵力，直捣永宁。
于是朱燮元明修栈道，在纳溪设疑兵，佯装将纳溪作为主攻方向，调动了叛军的主力，但实际上暗度陈仓，暗中集中主力于长宁，进兵永宁。
一路上官军连战皆捷。到四月，终于一举攻克了永宁。
五月时，又攻克了蔺州。
逼得奢崇明父子不得不率余部败退水西龙场，投靠贵州安邦彦。后又分兵犯永宁、遵义，皆被被川军击退。
四川总兵官李维新、监军副使李仙品、佥事监军刘可训等，统率各将，分五路进兵龙场，擒获奢崇明妻安氏、弟奢崇辉及叛军大学士、经略、丞相、总督等文官武将多人，斩首万余人，奢崇明父子受伤率领残部逃跑。
此时，新任贵州巡抚王三善也率军长驱直入，夺下了水西安氏的老巣大方，逼得水西土司安位和他的母亲奢社辉逃到火灼堡，安邦彦也逃到了织金。安位乞降。
当时形势可谓一片大好。
只可惜当时朝廷认为胜局在握，于是想通过这个机会，推行改土归流，下令废除水西、永宁宣