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其余被捕的义军首领被鞑子残酷杀害，但对阎尔梅这个名动大江南北的名士，沈文奎却只是将他关押起来，希望能够劝降于他。
在此期间，他昔日的亲朋好友纷纷劝诱他出仕新朝。投靠清廷后任巡抚的赵福星和吏部尚书陈名夏都曾拉拢他入仕清廷，均被其断然回绝。
整整两年的牢狱生活，却没有改变阎尔梅的坚持，他反清复明的痴心仍然炽烈，永历九年的时候，他终于在义士的帮助下成功地逃离了关押他整整两年的济南监狱，潜回了老家沛县。
次年，清军抄没了阎家，其妻妾被逼双双自杀，阎尔梅携幼子逃往河南，过起了颠沛流离的生活。一直到大兴军收复南京之后，他听闻昔日好友顾炎武也在汉王李元利帐下之时，他才赶到南京来，与李元利一席长谈之后，欣然和顾炎武一样，做了李元利的幕僚。
与他一同来投李元利的，还有当年同为“复社”巨子的方以智。
明末四公子之一的方以智，因家学渊源，博采众长，学识涵盖文、史、哲、地、医药、物理，可称广博。
而另一名来投的王夫之，也是一名抗清志士，这些年来同样四处奔走，欲图“反清复明”。
这三个人，都是意志