当李元利正在轰轰烈烈地练兵、屯田、建设时，四川的形势又发生了巨大的变化。
在这之前，大西军孙可望已经离开云南并占领了贵州境，派刘文秀所部已经基本上平定了四川，社会生产也在逐步恢复，这种情况下，满清朝廷在给吴三桂颁发平西王金册金印的同一天，即顺治八年（1651年）九月八日，同时向他发布了出征四川的命令。
这次的皇帝诏令，给了吴三桂比以往更大的权力，把地方的军事大权都交他掌管，授予他奖惩、生杀大权，不得不说，此时才年方十三岁的满清小皇帝顺治，已经具有了很厉害的战略眼光和胆识，但很有可能是投靠清廷的汉臣献计。
此时的四川虽然连年遭受兵灾，但人口却还剩下不少，如果等刘文秀在四川站稳脚跟，只要过上两三年，必定是兵多粮足，清廷要想一统天下，绝对要付出更多的代价。
刘文秀这一次进川，把原来盘踞在川中割据自雄的各路流贼、明军残余武装以及地方豪强武装都一一消灭或者收编，并且在各地分派官员，招抚百姓，恢复生产。
就在这个时候，吴三桂来了！
顺治九年（1652年）二月，刚刚开春，平西王吴三桂与定西将军墨尔根侍卫李国翰